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中国用发酵法制取柠檬酸以1942年汤腾汉等报告为早。1952年陈声等开始用黑曲霉浅盘发酵制取柠檬酸。轻工业部发酵工业科学研究所于1959年完成了200l规模深层发酵制柠檬酸试验。
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提取
在柠檬酸发酵液中，除了主要产物外，还含有其他代谢产物和一些杂质，如草酸、葡萄糖酸、蛋白质、胶体物质等，成分十分复杂，必须通过物理和化学方法将柠檬酸提取出来。大多数工厂仍是采用碳酸钙中和及硫酸酸解的工艺提取柠檬酸。随着菌体生成，发酵液中的溶解氧会逐渐降低，从而抑制了柠檬酸的合成。除此之外，还研究成功用萃取法、电渗析法和离子交换法提取柠檬酸。
由于制备柠檬酸钠的原料基本来源于粮食，因而安全可靠，对人类健康不会产生危害。联合国粮农与世界卫生组织对其每日摄人量不作任何限制，可认为该品属于无害品。这样，依靠从柑橘中提取天然柠檬酸的方法逐渐为发酵柠檬酸所取代。不过，枸橼酸根与血中钙离子形成难解离的络合物，钙离子是凝血过程中所需的物质之一，血液中钙离子减少，而使血液凝固受阻。在临床上采取新鲜血液时,柠檬酸钠就作为剂。
柠檬酸是可以直接吃的。柠檬酸是一种常见的有机酸，广泛存在于酸味水果中，比如柑橘、柠檬、菠萝等水果中，也是这些水果中酸味的主要来源。柠檬酸具有杀菌/收敛的作用，所以正常人适度食用柠檬酸对正常人是有益的。
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